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Crystal structure of amylomaltase from Thermus aquaticus, a glycosyltransferase catalyzing the production of large cyclic glucans

Przylas, I.; Tomoo, K.; Terada, Y.; Takaha, T.; Fujii, K.; Saenger, W.; Strater, N.; J. Mol. Biol. 296, 873-886 (2000)

Data extracted from this reference:

Cloned(Commentary)
Commentary
Organism
-
Chlamydia pneumoniae
-
Clostridium butyricum
genes for amylomaltase are part of the glycogen operon
Aquifex aeolicus
genes for amylomaltase are part of the glycogen operon
Haemophilus influenzae
seuence determined
Escherichia coli
Crystallization (Commentary)
Crystallization
Organism
crystals belong to space group P6(4) with cell parameters a = b = 154 A and c = 64 A
Thermus aquaticus
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
maltopentaose + maltopentaose
Thermus aquaticus
metabolism of starch in the bacterium
maltooligosaccharides
-
Thermus aquaticus
?
maltopentaose + maltopentaose
Escherichia coli
metabolism of starch in the bacterium
maltooligosaccharides
-
Escherichia coli
?
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Aquifex aeolicus
-
-
-
Chlamydia pneumoniae
-
-
-
Clostridium butyricum
-
-
-
Escherichia coli
-
-
-
Haemophilus influenzae
-
-
-
Solanum tuberosum
-
-
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Thermus aquaticus
-
-
-
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)m
-
489019
Escherichia coli
cyclic(alpha-1,4-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Escherichia coli
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)m
-
489019
Solanum tuberosum
cyclic(alpha-1,4-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Solanum tuberosum
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)n
-
489019
Escherichia coli
(alpha-1,4-D-glucan)m-x + (alpha-1,4-D-glucan)n+x
-
489019
Escherichia coli
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)n
-
489019
Solanum tuberosum
(alpha-1,4-D-glucan)m-x + (alpha-1,4-D-glucan)n+x
-
489019
Solanum tuberosum
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + H2O
-
489019
Escherichia coli
(alpha-1,4-D-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Escherichia coli
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + H2O
-
489019
Solanum tuberosum
(alpha-1,4-D-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Solanum tuberosum
r
amylose + maltopentaose
-
489019
Thermus aquaticus
cyclic alpha-1,4-glucan
cycloamylose
489019
Thermus aquaticus
?
amylose + maltopentaose
-
489019
Solanum tuberosum
cyclic alpha-1,4-glucan
cycloamylose
489019
Solanum tuberosum
?
maltopentaose + maltopentaose
metabolism of starch in the bacterium
489019
Thermus aquaticus
maltooligosaccharides
-
489019
Thermus aquaticus
?
maltopentaose + maltopentaose
metabolism of starch in the bacterium
489019
Escherichia coli
maltooligosaccharides
-
489019
Escherichia coli
?
Cloned(Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
genes for amylomaltase are part of the glycogen operon
Aquifex aeolicus
-
Chlamydia pneumoniae
-
Clostridium butyricum
seuence determined
Escherichia coli
genes for amylomaltase are part of the glycogen operon
Haemophilus influenzae
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Crystallization
Organism
crystals belong to space group P6(4) with cell parameters a = b = 154 A and c = 64 A
Thermus aquaticus
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
maltopentaose + maltopentaose
Thermus aquaticus
metabolism of starch in the bacterium
maltooligosaccharides
-
Thermus aquaticus
?
maltopentaose + maltopentaose
Escherichia coli
metabolism of starch in the bacterium
maltooligosaccharides
-
Escherichia coli
?
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)m
-
489019
Escherichia coli
cyclic(alpha-1,4-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Escherichia coli
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)m
-
489019
Solanum tuberosum
cyclic(alpha-1,4-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Solanum tuberosum
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)n
-
489019
Escherichia coli
(alpha-1,4-D-glucan)m-x + (alpha-1,4-D-glucan)n+x
-
489019
Escherichia coli
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + (alpha-1,4-D-glucan)n
-
489019
Solanum tuberosum
(alpha-1,4-D-glucan)m-x + (alpha-1,4-D-glucan)n+x
-
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Solanum tuberosum
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + H2O
-
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Escherichia coli
(alpha-1,4-D-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
489019
Escherichia coli
r
(alpha-1,4-D-glucan)m + H2O
-
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Solanum tuberosum
(alpha-1,4-D-glucan)x + (alpha-1,4-D-glucan)m-x
-
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Solanum tuberosum
r
amylose + maltopentaose
-
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Thermus aquaticus
cyclic alpha-1,4-glucan
cycloamylose
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Thermus aquaticus
?
amylose + maltopentaose
-
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Solanum tuberosum
cyclic alpha-1,4-glucan
cycloamylose
489019
Solanum tuberosum
?
maltopentaose + maltopentaose
metabolism of starch in the bacterium
489019
Thermus aquaticus
maltooligosaccharides
-
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Thermus aquaticus
?
maltopentaose + maltopentaose
metabolism of starch in the bacterium
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Escherichia coli
maltooligosaccharides
-
489019
Escherichia coli
?
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No.
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organims
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Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Nimpiboon
Mutagenesis for improvement of ...
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Ispection of the activator bin ...
Sus scrofa
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Enzymatic synthesis and proper ...
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The unique glycoside hydrolase ...
Borreliella burgdorferi
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Meissner
Thermotoga maritima maltosylt ...
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Goda
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Jeon
4-alpha-glucanotransferase fro ...
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Tachibana
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Cloning and expression of the ...
Dictyoglomus thermophilum, Pyrococcus furiosus, Pyrococcus sp., Pyrococcus sp. KOD1
J. Ferment. Bioeng.
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